1. 增值税的征收分小规模纳税人和一般纳税人，分别处理。
2. 小规模纳税人采用简易征收，增值税征收率为3%，仅能开具普通发票（3%）；
一般纳税人采用进项税额抵扣销项税额的核算方式，增值税税率为17%，可向增值税一般纳税人开具专用发票（17%），可接受增值税专用发票进行抵扣。
3. 一般的药品视为普通商品征税，根据销售方是否为一般纳税人来判断使用的税率（17%）或征收率（3%）。
4. 对于特殊的药品，如避孕药，国产抗艾滋药品等，可享受增值税免税优惠政策，在向主管税务机关备案后，可免征增值税。
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