我用的三菱A系列的PLC与电脑通讯不上啊，错误提示为：请确认COM端口设置 。我都已经检查过电脑和PLC的COM

说实话，这个对于新手来说，比较难。这个项目如果由工程公司来做，估计要十几万块。光软件的开发一处，就绝对不是一个人短时间能做的来的。所以，请你先重新检查一下他们聘用你的诚意。
你只说了你的系统的输入部分，没有说具体的输出控制对象。
1.读条形码可以用扫卡器（不知道学名是什么），RS232口的有很多，直接接上位机。
2.光电传感器种类太多了，我见过SUNX＋三菱Q PLC+网络模块＋上位机的连接方法。各个厂家的产品都差不多，接法相同。好像也有传感器直接接上位机的，我没用过。
3.软件，这里最难，我也不太懂。当然可以用VB做底层开发。你也别指望能从网络上下载到什么优秀的工控软件。厂家都是指着它卖钱的。
大体的思路是这样的，输入元件采集信号，通过以太网传输，在PC机上由操作者监视、干预、操作，再通过输出设备控制产品去向。
仅能帮你这么多了。
补充一下：我们这里的系统使用的是 Intouch 作为编程软件的。图形界面，我觉得不错。可惜人家不肯给我安装文件。

电脑的COM口有很多，可能是8个，但是应用软件的COM口却只有一个，先查看软件是用的什么口与电脑通信，根据软件的口去设置电脑的口。

波特率

端口设置

你用的是232接口吧？可能是你的接口有问题没有接好。