两者的性质不一样。1、安徽工程大学是一所以理工为主的省属多科性高等院校和安徽省重点建设院校，就是所谓的省内重点大学。校址在芜湖。2、安徽工程大学机电学院是民办本科，也就是现在很流行的独立学院，办学母体是安徽工程大学。如果没有意外的话，毕业以后拿到的学位证是安徽工程大学的，毕业证是机电学院的。说白了，机电学院级比安徽工程大学低一个级别。
