国立的话建议你去京都大学,或者东京理工大学,公立的京都府立大,他们的实力在日本都是非常不错的。你的学历的话要大学毕业,受过16年正规教育。
如果你想直接读研的话,你一定要有日语一级证书,日语一级是很多国立和公立大学对于留学生入学的基本条件。
不管你去哪个学校,你都必须要找到和你专业相关的教授(你只要找到大学的网页,会有科目和教授的介绍,那里会写有和他们的联系方法),和他联系,告诉他你在大学里学了些什么,关键是你的毕业论文内容要和教授研究的课题相关,如果教授同意接收你的话,他会对你进行相应的辅导以及沟通,(至少我是这样的情况)当然即使这样也是不能够保证100%可以入学,你还要通过入学笔试和面试,面试一般会有你选择的教授参加,但他不会是主考。一般来说面试的时候他会问你为什么选择这所学校,为什么选这个专业,你准备研究什么课题,你大学的毕业论文是什么内容,以及你将来的打算,这些问题几乎是哪个学校都会问的。
其他的学校我不是很熟悉,我就和你说说京都大学吧,京大是日本的名门,他的教授一般都会要求非常的严格,如果你的英语很好的话会非常有利,如果你之前没有在日本留过学的经历的话,即使你有日语一级水平,教授一般也不会同意你直接考研跟他,他可能多数会建议你用一年或者半年的时间做他的研究生(相当于旁听生)他会找他的助教或者你的前辈来一起帮助你,指导你,这样可以帮助你习惯他的讲课方式,以及大学院的研究方式。只有这样你才能更有把握考得上。
建议你最好给自己至少半年左右的时间适应,因为日本的国立大学真的并不好进。
祝你成功。