《永乐大典》的编篡使许多古代文献得以保存，成书后，一直为明代帝王御用之物。清朝乾隆年间开《四库全书》馆时，共从《永乐大典》中辑出385种典籍，4946卷。其中不乏价值甚高的典籍，如二十四史之一的《旧五代史》，重要史籍《建炎以来系年要录》。陈振孙《直斋书录题解》，医学名著《苏沈良方》以及《读资治通鉴长编》和《水经注》等都很著名。所辑宋元人诗文集中，著名的有宋人夏竦《文庄集》36卷，刘分文《彭城集》40卷，宋痒《宋元宪集》40卷，元人陆文至《墙束类稿》20卷等等。后来徐松又从《永乐大典》中辑出《宋会要》500卷，《宋中兴礼书》、《读中兴礼书》150卷。现代人编辑的《全宋词》、《全金元词》有不少来自《永乐大典》。《永乐大典》征引的书籍，均据文渊阁所藏宋、金、元精本摹写，与现存通行本相校勘，足可订正今本字讹误。清代学者曾用《永乐大典》校勘群书。时至今日，仍可利用《永乐大典》进行辑佚和校勘工作。
《永乐大典》包括各种门类的学科，可以说是我国第一部大百科全书，同时也是世界上最早的一部大百科全书，在世界文化史上具有很高的地位。
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