两者之间最大的区别就是酸性玻璃胶具有腐蚀性，而中性胶没有。
酸性胶干的很快，在正常情况下只需要几分钟表面就可以干透，但是中性胶干的就相对而言比较慢一些。当你选择哪种类型玻璃胶的时候，可以看你的主要需求来决定，如果这个东西有可能会被腐蚀掉，那就买中性胶，反之则可以考虑酸性胶。但是一般来说，中性胶的适用范围可能更广泛一些。
硅酮玻璃胶按酸碱性质又分为酸性胶和中性胶两种。
酸性玻璃胶主要用于玻璃和其它建筑材料之间的一般性粘接。
中性胶克服了酸性胶腐蚀金属材料和与碱性材料发生反应的特点，因此适用范围更广，其市场价格比酸性胶稍高。
市场上比较特殊的一类中性玻璃胶是硅酮结构密封胶，因其直接用于玻璃幕墙的金属和玻璃结构或非结构性粘合装配，故质量要求和产品档次是玻璃胶中最高的，其市场价格也最高。
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